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1、基于微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)長(zhǎng)江江蘇段鳙增殖放流效果評(píng)估
作者:馮曉婷,楊習(xí)文,楊雪軍,劉熠,周彥鋒,方弟安,徐東坡
作者單位:1. 上海海洋大學(xué)水產(chǎn)科學(xué)國(guó)家級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心 2. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心
出版日期:2019-10
為評(píng)估長(zhǎng)江江蘇段鳙(Aristichthys nobilis)增殖放流效果,本研究基于微衛(wèi)星標(biāo)記的親子鑒定技術(shù),選用10對(duì)擴(kuò)增效果穩(wěn)定的微衛(wèi)星熒光標(biāo)記引物,結(jié)合毛細(xì)管電泳對(duì)江蘇省內(nèi)良種場(chǎng)563尾鳙親魚和長(zhǎng)江江蘇段687尾回捕鳙進(jìn)行基因分型,并對(duì)位點(diǎn)多態(tài)性及親子鑒定結(jié)果進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,各位點(diǎn)等位基因介于19~55之間,其觀測(cè)雜合度為0.530~0.909(平均值為0.748),期望雜合度為0.818~0.929(平均值為0.882),多態(tài)性信息含量為0.797~0.924(平均值為0.871); Cervus3.0模擬結(jié)果顯示,當(dāng)雙親未知且置信度為95%時(shí),10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的累積非親權(quán)排除率為99.996%。親子鑒定結(jié)果發(fā)現(xiàn),所有回捕鳙中有42尾與親本之間存在親子關(guān)系,被確認(rèn)來(lái)源于鳙增殖放流群體,并由此推算此次評(píng)估親本的放流子代對(duì)長(zhǎng)江江蘇段野生群體的貢獻(xiàn)率為6.11%。結(jié)果顯示該研究進(jìn)行的鳙親子鑒定技術(shù)可為長(zhǎng)江鳙增殖放流效果評(píng)估工作提供可靠的數(shù)據(jù)支撐,為長(zhǎng)江漁業(yè)資源管理提供參考資料。
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2、182份東北地區(qū)受保護(hù)大豆品種DNA指紋庫(kù)的構(gòu)建及分析
作者: 趙艷杰,馮艷芳,黃思思,馬瑩雪,李嬡嬡,張蝶,鄧超,韓瑞璽,唐浩
作者單位:農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技發(fā)展中心
出版日期:2019-10-23
為評(píng)估東北地區(qū)受保護(hù)大豆品種遺傳多樣性,利用40對(duì)SSR引物結(jié)合熒光毛細(xì)管電泳技術(shù),構(gòu)建了182份東北地區(qū)已授予植物新品種權(quán)的大豆品種DNA指紋庫(kù)。182份大豆品種共擴(kuò)增出266種基因型,每對(duì)引物的等位變異數(shù)為4-20種不等,平均每對(duì)引物產(chǎn)生11.05種基因型。聚類分析結(jié)果表明,182份大豆品種之間的遺傳相似系數(shù)的變化范圍是0.4887-1.0000,平均相似系數(shù)為0.7785,遺傳基礎(chǔ)較窄。聚類結(jié)果顯示,182份大豆品種可聚合成13大類,黑農(nóng)系列品種間、墾豆系列品種間聚合緊密,遺傳基礎(chǔ)相對(duì)較窄,合農(nóng)系列品種間、吉育系列品種間、綏農(nóng)系列品種間距離較遠(yuǎn),遺傳基礎(chǔ)相對(duì)較寬。考察3個(gè)DNA指紋相同的品種合農(nóng)75、合豐50號(hào)、龍墾335的田間表型,發(fā)現(xiàn)合農(nóng)75與合豐50號(hào)表型差異較小,合農(nóng)75與龍墾335表型差異較大,因此DNA指紋圖譜庫(kù)可以為特異性(可區(qū)別性)判定時(shí)輔助篩選近似品種提供參考,但品種特異性(可區(qū)別性)的最終判定還需要依靠田間種植對(duì)比試驗(yàn)。
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3、白菜類蔬菜種子純度SSR分子標(biāo)記鑒定
作者:徐營(yíng)莉,華德平,張紅,王超楠,黃志銀,范偉強(qiáng),溫娟娟,張斌
作者單位:1. 天津師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 2. 天津大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 3. 天津科潤(rùn)蔬菜研究所蔬菜種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 4.天津市蔬菜遺傳育種企業(yè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
出版日期:2019-10-31
種子純度是種子質(zhì)量的核心指標(biāo),是保障優(yōu)良品種增產(chǎn)的關(guān)鍵因素。為了鑒定白菜種子純度,本研究利用72對(duì)SSR分子標(biāo)記檢測(cè)種子純度并結(jié)合田間植株形態(tài)觀察,鑒定了5個(gè)白菜類優(yōu)勢(shì)品種的種子純度,分別是珍綠6號(hào),津夏3號(hào),津研快綠1號(hào),速俊228,速俊316。結(jié)果表明,從72對(duì)SSR引物中篩選出5對(duì)具有多態(tài)性的引物,能夠?qū)⒏改副九c雜交種區(qū)分開。試驗(yàn)中SSR分子鑒定結(jié)果雖略低于田間形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果,但利用統(tǒng)計(jì)學(xué)進(jìn)行顯著性分析,發(fā)現(xiàn)兩者間無(wú)顯著性差異。說(shuō)明SSR分子標(biāo)記可以用于白菜種子純度的鑒定。本研究建立了一套準(zhǔn)確、有效的品種純度鑒定體系。
4、郁金香SSR-PCR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化
作者:馬秀花,唐楠,唐道城
作者單位:青海大學(xué)青海省園林植物與觀賞園藝重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/青海大學(xué)高原花卉研究中心
出版日期:2019-10-30
為建立郁金香SSR-PCR反應(yīng)體系,本研究以36個(gè)荷蘭引進(jìn)的郁金香栽培品種和5個(gè)產(chǎn)于中國(guó)新疆的野生種為試驗(yàn)材料,采用單因素試驗(yàn)和L16(45)正交設(shè)計(jì)相結(jié)合的方法,對(duì)影響郁金香SSR-PCR反應(yīng)的Mg2+濃度、dNTPs濃度、引物濃度、模板DNA、Taq酶用量進(jìn)行優(yōu)化,建立最佳的SSR-PCR反應(yīng)體系,并利用3對(duì)引物在41份郁金香材料中驗(yàn)證反應(yīng)體系的穩(wěn)定性。結(jié)果表明:在20 μL的PCR反應(yīng)體系中,10×PCR Buffer (Mg2+ free)2 μL、Mg2+ 2.0 mmol/L、dNTPs 0.75 mmol/L、引物2.0 μmol/L、模板DNA 10 ng、Taq酶0.15 U為最優(yōu)體系;通過(guò)正交試驗(yàn)確定5個(gè)因子對(duì)SSR-PCR體系的影響程度為:模板DNA>Taq酶>引物>Mg2+>dNTPs。篩選出的3對(duì)引物在41份郁金香材料中均可擴(kuò)增出目的條帶,表明該體系的穩(wěn)定性好。本研究建立SSR-PCR反應(yīng)體系,為郁金香SSR標(biāo)記的開發(fā)以及遺傳多樣性分析、品種指紋圖譜構(gòu)建、種質(zhì)資源鑒定等方面提供了幫助。
5、35份重慶大茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析
作者:羅亦紓,張霞,毛君林,李華鈞,劉勤晉,童華榮,梁國(guó)魯,魏旭
作者單位:1. 西南大學(xué)食品科學(xué)學(xué)院 2. 重慶市古樹茶研究院 3. 西南大學(xué)園藝園林學(xué)院
出版日期:2019-10-14
茶樹是中國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)植物,遺傳多樣性分析對(duì)于其種質(zhì)資源的評(píng)價(jià)與保存十分重要。本研究采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)35份重慶大茶樹種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析,用梯度PCR儀對(duì)22對(duì)SSR引物進(jìn)行擴(kuò)增篩選,獲得21對(duì)多態(tài)性引物。用21對(duì)引物對(duì)35份大茶樹種質(zhì)擴(kuò)增,經(jīng)8%非變性聚丙烯酰胺電泳檢測(cè),共擴(kuò)增出48個(gè)條帶,多態(tài)性條帶38個(gè),多態(tài)帶百分率為79.17%。35份種質(zhì)的遺傳距離在0.313~0.955之間。UPGMA聚類分析顯示,35份重慶大茶樹種質(zhì)在遺傳相似系數(shù)為0.702時(shí)可分為5個(gè)聚類,親緣關(guān)系最近的是"南川1號(hào)"和"南川2號(hào)"。
6、基于SSR標(biāo)記的山西高粱地方品種遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析
作者:李萌,秦慧彬,王宇楠,閆建俊,穆志新
作者單位:1. 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)作物品種資源研究所農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/雜糧種質(zhì)資源發(fā)掘與遺傳改良山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 2. 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
出版日期:2019-10-11
為了從分子水平分析山西省高粱地方品種的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),本研究從140對(duì)SSR引物中篩選到22對(duì)條帶清晰且多態(tài)性穩(wěn)定的引物,對(duì)來(lái)自于山西省11個(gè)地區(qū)66個(gè)縣市的158份高粱材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析,結(jié)果共檢測(cè)到147個(gè)等位基因的位點(diǎn)變異,平均等位基因數(shù)為6.68。每個(gè)SSR位點(diǎn)的多態(tài)性信息含量(PIC)平均為0.635,變異范圍為0.168~0.870,表明山西高粱的地方品種具有較豐富的多態(tài)性。針對(duì)11個(gè)不同地理居群的遺傳多樣性分析表明,不同的地理居群間遺傳分化水平差異較大,地理居群間存在不同程度的基因交流。無(wú)論從等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)還是Shannon’s信息指數(shù)上,都可以看出忻州居群的遺傳多樣性最高,而陽(yáng)泉居群的最低。針對(duì)各地理居群間遺傳距離的分析結(jié)果表明,忻州居群和晉中居群的遺傳距離最小,兩個(gè)群體的親緣關(guān)系較近,基因交流比較頻繁。而陽(yáng)泉居群和其他居群間的遺傳距離都較大,顯示陽(yáng)泉居群與其他居群之間的基因交流阻隔,進(jìn)一步顯示了陽(yáng)泉居群的獨(dú)特性?;谀P偷倪z傳結(jié)構(gòu)分析和基于遺傳距離的N-J聚類分析都將種質(zhì)材料劃分為2個(gè)類群,不同地區(qū)高粱資源居群間的遺傳關(guān)系遠(yuǎn)近與其地理信息并沒有明顯的相關(guān)性。本研究旨在為高粱種質(zhì)資源的收集、鑒定與創(chuàng)新提供理論依據(jù)。
7、百合熒光SSR標(biāo)記體系構(gòu)建及引物篩選
作者:周俐宏,石慧,王志剛,蔡忠杰
作者單位:1. 遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院花卉研究所 2. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院
出版日期:2019-10-28
為了確定百合熒光SSR-PCR反應(yīng)的最佳體系,對(duì)反應(yīng)體系和程序中的模板DNA、酶量和退火溫度進(jìn)行了優(yōu)化篩選。結(jié)果表明,適用于百合的熒光SSR-PCR反應(yīng)體系為:總體系為20μl,10×PCR buffer(Mg2+)2μl,2.5 mM dNTP 1μl,正、反引物各0.5μl,模板DNA 40 ng,Taq酶1 U,用ddH2O補(bǔ)足。反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5 min,94℃(30 s)/58℃(45 s)/72℃(45 s)35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min。利用優(yōu)化后的反應(yīng)體系對(duì)百合SSR引物進(jìn)行篩選,從50對(duì)引物中篩選出6對(duì)多態(tài)性高的SSR引物,并通過(guò)合成熒光標(biāo)記引物對(duì)77個(gè)百合品(野生)種進(jìn)行復(fù)選,驗(yàn)證了6對(duì)引物的穩(wěn)定性。該研究為百合的遺傳多樣性分析、分子標(biāo)記輔助育種等方面的進(jìn)一步研究提供了技術(shù)支持。
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8、款冬轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記開發(fā)及其多態(tài)性研究
作者: 賀潤(rùn)麗,韓毅麗,段靜靜,劉計(jì)權(quán),王莉花
作者單位:1. 山西中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院 2. 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室農(nóng)業(yè)部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
出版日期:2019-10-28
分析款冬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的簡(jiǎn)單重復(fù)序列標(biāo)記(SSR)位點(diǎn)信息并設(shè)計(jì)特異引物,以期為款冬分子標(biāo)記輔助育種提供有力工具。對(duì)款冬轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)庫(kù)中長(zhǎng)度1 kb以上的18938條unigene,利用MISA軟件搜索SSR位點(diǎn)信息,利用Primer3設(shè)計(jì)引物,并隨機(jī)選擇55對(duì)SSR引物分析18份不同來(lái)源款冬材料的多態(tài)性。結(jié)果共搜索到4688個(gè)SSR位點(diǎn),分布于3844條unigene中,SSR出現(xiàn)頻率為24.75%,平均7979bp含1個(gè)SSR位點(diǎn)。SSR位點(diǎn)中三核苷酸重復(fù)類型出現(xiàn)頻率最高(37.12%),其次是單核苷酸重復(fù)(32.36%)和二核苷酸重復(fù)(28.20%)。共有60種重復(fù)基元,其中A/T(31.42%)、AG/CT(12.80%)、ATC/ATG(9.62%)是優(yōu)勢(shì)重復(fù)基元。隨機(jī)選擇55對(duì)引物進(jìn)行多態(tài)性驗(yàn)證分析,其中42對(duì)有擴(kuò)增產(chǎn)物,14對(duì)具穩(wěn)定可重復(fù)的多態(tài)性;利用UPGMA作圖,將18份樣品分為3類??疃D(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)出現(xiàn)頻率高,類型豐富,多態(tài)性高,為其遺傳多樣性分析、遺傳圖譜構(gòu)建和分子標(biāo)記輔助育種等研究提供了候選分子標(biāo)記。
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9、長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠SSR位點(diǎn)的篩選與擴(kuò)增
作者:楊新根,張育平,郭紅芳,張建珍,武振榮,王庭林,鄒波,常文英,侯玉
作者單位:1.山西大學(xué)應(yīng)用生物學(xué)研究所,2. 山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 3. 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所 4. 農(nóng)業(yè)有害生物綜合治理山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 5. 太原師范學(xué)院生物系 6. 五臺(tái)縣林業(yè)工作站
出版日期:2019-10-20
利用從山西省11個(gè)地市共計(jì)13個(gè)縣(市)野外捕捉的132只長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠為試驗(yàn)材料,先提取其基因組DNA,然后應(yīng)用查閱的近源種黑線倉(cāng)鼠的6對(duì)SSR位點(diǎn)引物(已登記在GeneBank)對(duì)長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳。結(jié)果表明,有5對(duì)引物擴(kuò)增效果較好,可用于長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠的遺傳多樣性研究。研究結(jié)果可對(duì)今后長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠的遺傳多樣性分析提供一定的理論基礎(chǔ)。
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10、短枝木麻黃無(wú)性系鑒定及其指紋圖譜構(gòu)建
作者:李松,張世成,董云武,施德林,史云東
作者單位:1. 玉溪師范學(xué)院化學(xué)生物與環(huán)境學(xué)院 2. 玉溪市種子管理站
出版日期:2019-10-15
本研究構(gòu)建木麻黃無(wú)性系的DNA指紋圖譜鑒定體系,為今后短枝木麻黃的品種鑒定、品種權(quán)保護(hù)、新品種的選育提供依據(jù)。從71對(duì)EST-SSR引物中篩選出擴(kuò)增條帶清晰、多態(tài)性好、擴(kuò)增穩(wěn)定的12對(duì)引物,采用降落PCR和毛細(xì)管電泳的基因分型方法,以采集的9個(gè)短枝木麻黃標(biāo)準(zhǔn)無(wú)性系的基因分型結(jié)果為參照,對(duì)華南沿海地區(qū)采集的109個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系單株進(jìn)行鑒定,并結(jié)合引物組合法構(gòu)建基于EST-SSR分子標(biāo)記的短枝木麻黃無(wú)性系鑒定體系。結(jié)果表明,12對(duì)EST-SSR引物對(duì)109個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系單株進(jìn)行PCR擴(kuò)增,共檢測(cè)到50個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)為3~6個(gè),平均為4.2個(gè),每對(duì)引物可區(qū)分2~5個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系。根據(jù)鑒定結(jié)果,最終所有樣品被劃分為22個(gè)無(wú)性系,除已知的9個(gè)標(biāo)準(zhǔn)無(wú)性系外,另有13個(gè)無(wú)性系為不知名無(wú)性系,說(shuō)明不同地區(qū)的無(wú)性系存在重復(fù)命名現(xiàn)象;利用引物組合法進(jìn)一步優(yōu)化后,發(fā)現(xiàn)只需7對(duì)引物就可將22個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系完全區(qū)分,并依此建立了基于7對(duì)EST-SSR引物的22個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系的指紋圖譜,每個(gè)無(wú)性系都獲得了一個(gè)7位數(shù)的指紋圖譜編碼。利用7對(duì)EST-SSR引物構(gòu)建的22個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系的DNA指紋圖譜可用于短枝木麻黃無(wú)性系的鑒別,研究表明,華南沿海地區(qū)部分短枝木麻黃無(wú)性系存在命名混亂、同物異名、無(wú)性系數(shù)量少的現(xiàn)象,新品種選育工作亟待開展和加強(qiáng)。
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11、大麥抗條紋病與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析
作者:司二靜,孟亞雄,李葆春,馬小樂,張宇,王化俊
作者單位:1. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省干旱生境作物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室甘肅省作物遺傳改良與種質(zhì)創(chuàng)新重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 2. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院 3. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院 4. 甘肅省種子管理局
出版日期:2019-10-15
為了解不同來(lái)源大麥的遺傳多樣性,并篩選與抗條紋病性狀相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記,采用三明治法通過(guò)人工接種大麥條紋病菌對(duì)180份大麥材料進(jìn)行抗性鑒定,通過(guò)119對(duì)多態(tài)性SSR引物對(duì)180份大麥材料進(jìn)行SSR標(biāo)記分析,并用一般線性模型(general lineal model,GLM)和混合線性模型(mixed lineal model,MLM)進(jìn)行大麥抗條紋病與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明,人工接種大麥條紋病菌后共鑒定出10份免疫、9份高抗、25份抗病、70份感病和66份高感大麥材料;119對(duì)多態(tài)性SSR引物從180份大麥材料中共檢測(cè)出559個(gè)等位變異位點(diǎn),平均為4.70個(gè),變幅為2~14個(gè),基因多樣性和多態(tài)性信息含量變幅分別為0.05~0.88和0.05~0.86;群體結(jié)構(gòu)分析表明供試大麥材料可分為2個(gè)亞群?;贕LM和MLM分別檢測(cè)到14個(gè)和10個(gè)與大麥條紋病抗性相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記,對(duì)表型變異的解釋率變幅分別為4.46%~9.76%和3.25%~7.87%,其中Scssr08238和BMS64標(biāo)記均與大麥條紋病抗性呈極顯著相關(guān),二者在GLM中解釋率分別為9.76%和8.00%,在MLM中解釋率分別為7.87%和5.61%。本研究所鑒定的大麥抗性種質(zhì)可作為抗源用于抗病育種,與抗性相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記可用于大麥抗條紋病的分子標(biāo)記輔助選擇育種。
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12、利用SSR構(gòu)建甜菜品種的分子身份證
作者:栗媛,王茂芊,邳植,吳則東
作者單位:1. 黑龍江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院甜菜研究所/黑龍江大學(xué)農(nóng)作物研究院 3. 黑龍江省甜菜工程技術(shù)研究中心
出版日期:2019-10-10
為了實(shí)現(xiàn)快速鑒定甜菜品種真實(shí)性以及純度的目的,本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)國(guó)內(nèi)已登記的部分甜菜品種進(jìn)行了指紋圖譜構(gòu)建。利用17對(duì)帶型清晰、重復(fù)性好、多態(tài)性高、易于識(shí)別的引物作為核心引物對(duì)39份甜菜品種的基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果表明,只需利用以下5對(duì)核心引物:LNX38、LNX95、SB06、SSD6和SB13,便可完全鑒別出39個(gè)甜菜品種。利用SSR引物構(gòu)建甜菜品種的分子身份證,真正達(dá)到了快速、高效地鑒定品種純度以及真實(shí)性的目的,也更有效地維護(hù)了甜菜品種市場(chǎng)的秩序,并保護(hù)了育種家的利益。
期刊首頁(yè)網(wǎng)址:http://www.zwyczy.cn/zwyczyxb/ch/index.aspx
13、不同類型甜瓜種質(zhì)SSR遺傳多樣性及耐冷性評(píng)價(jià)
作者:徐小軍,劉海英,梁長(zhǎng)志,王吉明,張桂蘭,楊路明,胡建斌
作者單位:1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所 2. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院
出版日期:2019-10-9
本研究從國(guó)家西瓜甜瓜種質(zhì)中期庫(kù)(鄭州)和美國(guó)農(nóng)業(yè)部國(guó)家種質(zhì)資源中心選取厚皮、薄皮和野生甜瓜種質(zhì)共191份,利用在甜瓜染色體上均勻分布的43個(gè)SSR標(biāo)記鑒定其基因型,評(píng)價(jià)其遺傳多樣性,并利用4℃恒溫條件下種質(zhì)幼苗的冷害指數(shù)和低溫處理前后的葉肉組織超微結(jié)構(gòu)變化評(píng)價(jià)不同類型種質(zhì)的耐冷性。結(jié)果顯示SSR標(biāo)記共檢測(cè)到366個(gè)等位基因,平均8.512,平均觀測(cè)雜合度和期望雜合度分別為0.074和0.704,平均多態(tài)性信息含量為0.668。UPGMA法將所有種質(zhì)聚為4個(gè)類群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ),Ⅰ群僅有2份印度野生種質(zhì),Ⅱ群包含來(lái)自印度的34份野生和15份薄皮種質(zhì),Ⅲ群含有地理分布廣泛的51份厚皮和1份野生種質(zhì),Ⅳ群由來(lái)自東亞的75份薄皮、7份厚皮和6份野生種質(zhì)組成。Bayesian算法將所有種質(zhì)分為3個(gè)亞群(P1、P2和P3),主要對(duì)應(yīng)厚皮、野生和薄皮3類種質(zhì)。通過(guò)計(jì)算3類種質(zhì)間的分化系數(shù)和雷氏距離,結(jié)果發(fā)現(xiàn)厚皮種質(zhì)與薄皮種質(zhì)間的分化最大,野生種質(zhì)與薄皮或厚皮種質(zhì)間的分化相對(duì)較小,不同類型種質(zhì)多樣性水平表現(xiàn)為:野生種質(zhì)>厚皮種質(zhì)>薄皮種質(zhì)。3類種質(zhì)幼苗的冷害指數(shù)趨向正態(tài)分布,薄皮種質(zhì)的耐冷性要優(yōu)于野生和厚皮種質(zhì)。葉肉組織超微觀察顯示,薄皮種質(zhì)‘蛤蟆酥5’在低溫處理前后的細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)變化不大,其耐冷性較強(qiáng),而厚皮種質(zhì)“鳳凰”在低溫處理后,葉綠體大量解體,細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)遭到破壞,其耐冷性較弱。
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14、42份云南玉米自交系基于SSR熒光標(biāo)記的遺傳多樣性分析
作者:張鵬,管俊嬌,黃清梅,王江民,楊曉洪,劉艷芳,張建華,毛進(jìn)
作者單位:1. 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與檢測(cè)技術(shù)研究所
出版日期:2019-10-15
本研究通過(guò)分析云南常用42份玉米自交系品種的遺傳多樣性,以及云南近些年新育成自交系的遺傳背景,為云南地區(qū)玉米育種提供參考依據(jù)。利用30對(duì)SSR多態(tài)性引物,對(duì)42個(gè)玉米自交系品種進(jìn)行等位基因多樣性和聚類分析,共檢測(cè)到277個(gè)等位基因變異,平均每個(gè)位點(diǎn)檢測(cè)到的等位基因數(shù)為9.2個(gè),變化范圍4~17個(gè),片段大小介于86~434 bp之間,每個(gè)SSR位點(diǎn)的多肽信息量(PIC)在0.7008~0.9979之間,平均為0.9712?;赨PGMA進(jìn)行遺傳聚類分析,供試材料分類不明顯,遺傳相似系數(shù)均大于0.82,遺傳相似度較高。目前由于大部分的玉米自交系品種都由骨干自交系而來(lái),品種資源狹窄、遺傳多樣性不夠豐富,導(dǎo)致新育成的玉米品種遺傳背景相似,血緣關(guān)系相近,因此亟需在品種資源的有效利用、資源評(píng)價(jià)、材料共享和交流等方面開展相關(guān)工作,促進(jìn)玉米種業(yè)發(fā)展。
關(guān)于天昊:
天昊生物可以提供SSR分子標(biāo)記的一代毛細(xì)管電泳檢測(cè),并且基于二代高通量測(cè)序技術(shù)開發(fā)出SSRseqTM專利技術(shù), 可以根據(jù)客戶項(xiàng)目需求,提供不同數(shù)量樣本和位點(diǎn)的高性價(jià)比SSR檢測(cè)服務(wù)。此外,我們還具有豐富的動(dòng)植物葉綠體、線粒體細(xì)胞器基因組隨機(jī)測(cè)序和DNA條形碼檢測(cè)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),為客戶檢測(cè)提供高效的技術(shù)支撐。我們期待成為您SSR分型、細(xì)胞器基因組測(cè)序和DNA條形碼檢測(cè)的優(yōu)質(zhì)服務(wù)合作伙伴,歡迎聯(lián)系我們具體咨詢!郵箱:techsupport@geneskies.com 電話:400-065-6886