動物基因組研究常用數(shù)據(jù)庫匯總（豬、羊、牛、馬、雞、小鼠等）

發(fā)稿時間：2019-08-22來源：天昊生物

為了使大家高效的利用動物基因組數(shù)據(jù)庫信息，更好的挑選感興趣基因及變異數(shù)據(jù)用于后續(xù)研究，小編整理了一些常用數(shù)據(jù)庫，供大家參考。

 

1、Animal QTLdb (豬、牛、羊、馬、雞等QTL信息)

網(wǎng)址：https://www.animalgenome.org/

 

 

2、Ensembl （比較基因組學、進化、序列變異和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究網(wǎng)站）

網(wǎng)址：http://asia.ensembl.org/index.html

 

 

3、UCSC Genome Browser Gateway （各類動物基因組信息綜合性網(wǎng)站）

網(wǎng)址：https://genome-asia.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway?redirect=manual&source=genome.ucsc.edu

 

 

4、Livestockgenomics數(shù)據(jù)庫 （牛、羊基因組及SNP芯片數(shù)據(jù)）

網(wǎng)址：http://www.livestockgenomics.csiro.au/

 

5、Mammalian Annotation Database （人、牛、豬、馬、兔子、狗、小鼠直系同源基因網(wǎng)站）

網(wǎng)址：https://madb.ethz.ch/

 

 

 

 

6、Mammalian Transcriptomic Database（MTD）（人、豬、小鼠、大鼠轉(zhuǎn)錄組信息）

網(wǎng)址：http://mtd.cbi.ac.cn/

 

 

7、LncRNAnet（關于豬、人、小鼠lncRNA的數(shù)據(jù)庫）

網(wǎng)址：http://lnc.rnanet.org/

 

 

8、iSheep（關于羊的品種、基因和變異的數(shù)據(jù)平臺）

網(wǎng)址：https://bigd.big.ac.cn/isheep/

 

 

9、ISCG (國際綿羊基因組學聯(lián)合會，SNP芯片等數(shù)據(jù))

網(wǎng)址：https://www.sheephapmap.org/

 

 

10、The Goat and Sheep DNA database

網(wǎng)址：https://www.itb.cnr.it/gosh/index.php

 

 

11、Goat Genome數(shù)據(jù)庫（羊SNP芯片等數(shù)據(jù)）

網(wǎng)址：http://www.goatgenome.org/projects.html

 

 

12、Mouse Genome Informatics （小鼠基因組數(shù)據(jù)庫）

網(wǎng)址：http://www.informatics.jax.org/

 

 

 

 

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天昊生物可以提供多種動物基因檢測及數(shù)據(jù)分析服務，我們利用自身研發(fā)的多項專利技術(shù)，包括SNPscan?高通量SNP分型技術(shù)、CNVplex?高通量DNA拷貝數(shù)檢測技術(shù)、SSRseq^TM超高通量SSR分型技術(shù)、MethylTarget?多重目的區(qū)域甲基化富集測序等技術(shù)，為您提供各種通量SNP基因分型分析、基因轉(zhuǎn)錄水平分析、甲基化水平分析等服務項目。同時還包括動物目的區(qū)域富集測序、全轉(zhuǎn)錄組測序、動物腸道16S/18S/ITS擴增子測序、宏基因組測序、線粒體基因組測序等成熟的科研分析服務。

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